Zero Background pTOPO-Blunt Cloning Kit
零背景pTOPO-Blunt平末端克隆試劑盒
包裝規(guī)格:
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V6002-20
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Zero Background pTOPO-Blunt Cloning Kit
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20T*10μL
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620元
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V6002-60
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Zero Background pTOPO-Blunt Cloning Kit
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20T*10μL
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1660元
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產(chǎn)品介紹:
本制品和傳統(tǒng)的T4連接酶原理不同,它利用了Topoisomerase可以在瞬間(幾秒鐘-幾分鐘)、高效(接近100%)連接DNA片段的原理。
1. 可以在瞬間(幾秒鐘-幾分鐘)完成連接。
2. 無需冰浴和熱休克,室溫5分鐘內(nèi)完成轉化;無需1小時復蘇,只需37℃10分鐘復蘇便可以涂板。從連接到涂板只需15-20分鐘。
3. 無自連、零背景,無需繁瑣藍白斑篩選,見到長出的克隆便是有插入的(接近100%)。
4. 可以連接長達10kb片段(即使連接5kb片段,挑10個菌落,至少8個是有插入的),是
一種簡單、快速、零背景免篩選的TOPO 平末端克隆載體。
產(chǎn)品存儲:-20℃儲存,至少6個月內(nèi)不影響使用效果。
注:本TOPO載體連接體系是按照10ml計算,如果按照其它公司產(chǎn)品5ml計算,實際使用次數(shù)可以增加一倍,20次實際可用40次。
測序可以采用 M13F/M13R通用引物測序(見后面圖譜)
操作步驟:
1.連接反應的準備:
PCR引物不能磷酸化。使用擴增產(chǎn)物是平末端的高保真聚合酶系列擴增(如Pfu、Vent、Phusion DNA Polymerase)。 PCR產(chǎn)物(僅有目的條帶、無非特異條帶和引物二聚體)可直接進行連接反應,無需純化,否則建議膠回收純化(貨號:DR01)。如果是以質粒為模板的PCR產(chǎn)物則最好進行純化,因為模板質粒也可能長出菌落(但不是想構建的目的載體)。
2.連接反應:
1)室溫(20℃-30℃)按照如下體系操作(10ml體系):
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純化后的PCR產(chǎn)物/或者1ul 1kb control
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0.5-8ul
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pTOPO-Blunt Vector
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1ul
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10 ′ Enhancer
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1ul
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滅菌水
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Xul
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總體積
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10ul
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加完試劑后,用移液器輕輕吹打混勻或者輕彈管底混勻,低速瞬時離心收集所有液體在離心管底,
注意此步驟不能在冰上進行,只能在室溫(20℃-30℃)進行。
注:如果使用5ml體系連接,各成分按照比例減半使用,使用次數(shù)可以加倍。
不同大小插入片段的推薦用量:
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插入片段大小(bp)
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最佳用量(ng)
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100-1000
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20-50
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1000-2000
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50-100
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2000-5000
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100-200
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2)室溫(20℃-30℃)連接5分鐘。
本載體推薦室溫5分鐘完成連接(不要超過5分鐘),但在很多情況下連接1-2分鐘已經(jīng)可以得到足夠多的轉化子。
3)連接產(chǎn)物可直接轉化感受態(tài)細胞或貯存于-20℃。
如尚未準備好感受態(tài)細胞,可以將連接產(chǎn)物短時間置于冰上備用。
3.轉化:
1)50-100ml感受態(tài)細胞,置于室溫解凍,完全解凍后(約1分鐘左右)輕撣幾次將細胞均勻懸浮。
2)加入5ml連接液(最多可全部加入,只要體積不超過感受態(tài)細胞體積的1/10),輕輕混勻,室溫放置5分鐘。
根據(jù)我們的經(jīng)驗,本公司載體使用商品化的感受態(tài)細胞不需要冰浴和熱休克、室溫放置5分鐘便可獲得足夠多轉化子,如果實驗室自制感受態(tài)細胞或者效率較低時,可以按照標準程序進行。
3)加300-500ml LB或者SOC培養(yǎng)基(不含抗生素),37℃ 180 rpm振蕩培養(yǎng)10分鐘。
根據(jù)我們的經(jīng)驗,一般可以直接將培養(yǎng)基(事先平衡至室溫) 加入感受態(tài)細胞的1.5 ml 離心管,蓋上離心管蓋,水平固定在振蕩培養(yǎng)箱中振蕩培養(yǎng)復蘇即可,不需要轉移到試管培養(yǎng)復蘇。
一般商品化的感受態(tài)細胞不超過2kb插入片段情況下,10分鐘復蘇可以得到足夠多轉化子,如果使用實驗室自制的感受態(tài)或者插入片段長轉化子少的情況下可以提高復蘇時間到30-60分鐘以得到更多的轉化子。
4)取200ml菌液涂板,培養(yǎng)過夜(如果預計轉化子少,為得到較多克隆,4000 rpm 離心1 min,吸棄掉部分上清,保留100-150ml,輕彈懸浮菌體,取全部菌液涂板)
4.轉化子的篩選鑒定:
本制品陽性率相當高,一般情況下,可以達到所見即所得,只要是長出來的菌落正常(不是污染的雜菌,轉化子數(shù)量也不算太少),基本就包含插入。因此插入片段不超過2-3kb的情況下可以不用鑒定直接挑1-2個菌去測序。
1).用上述培養(yǎng)的白色菌落的菌液抽提質粒,插入片段較大的情況下,直接跑電泳看質粒大小就直接能鑒定出有插入的質粒,還可用EcoR I/Ecor V雙酶切釋放插入片段或用其它合適的酶切,瓊脂糖凝膠電泳檢查片段大小,確定是否含有目的片段。
2).挑取菌落直接進行PCR檢測(可參見分子克隆第3版本或者咨詢我們)。
3).用通用M13F/M13R引物測序來確定是否含有目的克隆。
pTOPO-Blunt載體圖譜:
pTOPO-Blunt載體通用測序引物序列:
M13F: TGTAAAACGACGGCCAGT
M13R: CAGGAAACAGCTATGACC
pTOPO-Blunt載體多克隆位點序列: