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DGGE微生物多樣性分析
普通的聚丙烯酰胺凝膠電泳只能通過片段大小不同在同一濃度的膠上電泳遷移率不同而分離不同的DNA片段,對于片段大小接近或相同的DNA片段無法做到有效地分離;DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis) 即變性梯度凝膠電泳,是利用DNA在不同濃度的變性劑中解鏈行為的不同而導(dǎo)致電泳遷移率發(fā)生變化,從而將片段大小相同而堿基組成不同的DNA片段分開。
DGGE作為一種成熟的分子生物學(xué)技術(shù)被廣泛應(yīng)用于環(huán)境科學(xué)(土壤、海洋、河流、冰川、淤泥等)、醫(yī)學(xué)(各種疾病治療前后,病變部位微生物的差異)、人體(鼻咽、口腔、黏膜、腸道)等領(lǐng)域進(jìn)行微生物多樣性分析。PCR-DGGE微生物多樣性分析技術(shù)可用于各種微生物生態(tài)系統(tǒng)包括土壤、活性污泥、人體和動物腸道、溫泉、極地、植物根系、海洋湖泊、油藏等等的多樣性進(jìn)行半定量和定量分析。
技術(shù)優(yōu)勢:
1、采用成熟的PCR-DGGE技術(shù)快速的對樣品進(jìn)行微生物多樣性分析,對測序結(jié)果進(jìn)行處理,保證序列的有效性和準(zhǔn)確性,便于后期測序結(jié)果的生物信息學(xué)分析。
2、掌握了成熟的PCR-DGGE實驗方案,擁有完善的實驗數(shù)據(jù)分析平臺。
實驗周期:
根據(jù)不同客戶的要求,實驗周期也不盡相同。我們在接到客戶提供的樣品后,即刻進(jìn)行實驗,至全部實驗及數(shù)據(jù)分析結(jié)束,一般控制在16-20個工作日內(nèi)完成。
送樣要求:
1、環(huán)境樣品
1)送樣樣品盡量保證新鮮,采樣后建議立即冰凍保存。
2)樣品在保存期間請勿反復(fù)凍融。
3)水樣樣品若是渾濁請在離心后送沉淀物,若是澄清水樣請使用濾膜過濾后,送濾膜進(jìn)行后續(xù)實驗;若是樣品中含有大量的腐殖質(zhì)酸、重金屬等PCR反應(yīng)抑制劑,請在送樣時注明。
4)請務(wù)必填寫完整的送樣訂單,并用自封袋密封后同樣品一起送樣,以便收到樣品后妥善保存。
2、環(huán)境樣品基因組DNA
1)請?zhí)峁舛却笥?0ng/uL,總量大于500ng的基因組DNA,OD260/280=1.8-2.0,并確保DNA無降解。
2)樣品在保存期間請勿反復(fù)凍融。
3)送樣務(wù)必標(biāo)清楚樣品編號,并用parafilm膜對管口進(jìn)行密封。
4)請務(wù)必填寫完整的送樣訂單,并用自封袋密封后同樣品一起送樣,同時將基因組DNA的照片發(fā)送至[email protected]
3、寄送樣品:
1)請按照我們的訂單填寫要求填寫訂單,并隨樣品一起寄送。
2)若是自己寄送快遞,請在寄送快遞前與公司聯(lián)系,以便樣品及時查收,妥善處理,避免不必要的麻煩。


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