技術(shù)原理:以SNP分型檢測為例,在PCR過程中,兩個探針能與正向引物和反向引物之間的互補序列特異退火結(jié)合。當探針以完整形式存在時,由于能量共振轉(zhuǎn)移,熒光基團只發(fā)出微弱熒光。特異的探針與相應(yīng)的等位基因雜交后,DNA聚合酶發(fā)揮5’外切酶活性,把報告熒光基團切割下來,從而發(fā)出熒光;而SNP探針的錯配形式不會引起切割,無熒光信號。MGB分子結(jié)合到DNA螺旋小溝,通過穩(wěn)定MGB探針/模板提高雜交穩(wěn)定性,使短至13個堿基的探針獲得高錯配區(qū)分辯別能力。MGB探針包括一個不發(fā)熒光的淬滅基團(NFQ),極大消除傳統(tǒng)淬滅基團產(chǎn)生的背景熒光,提高信噪比,從而提高檢驗靈敏性。
原理及流程示意圖:
技術(shù)優(yōu)勢:
1. 采用最先進的ABI 7900HT系統(tǒng)采用激光掃描并激活96/384孔板每個反應(yīng)孔的熒光染料,熒光信號通過光柵分光,經(jīng)過分離的多色熒光同時到達CCD攝像機,實現(xiàn)多色熒光同時檢測。
2. 采用ABI 專利技術(shù)的TaqMan-MGB 探針:MGB探針包括一個不發(fā)熒光的淬滅基團(NFQ),極大消除傳統(tǒng)淬滅基團產(chǎn)生的背景熒光,提高信噪比,從而提高檢驗靈敏性,另外MGB(小溝結(jié)合物)增加Tm值,使探針設(shè)計產(chǎn)度縮短至約15bp,提高了探針設(shè)計的靈活性。
技術(shù)特點:
1. 適合位點少,樣本通量高的檢測,每個位點需要合成一對探針,探針合成費用高;
2. 應(yīng)用ABI7900、ABI7500定量PCR儀進行定量檢測;
3. 操作簡便,只需一步 PCR 反應(yīng),無須純化和預(yù)處理,直接上機檢測;
4. 結(jié)果清晰,軟件分析結(jié)果界面友好,標出每個樣本的基因型及熒光強度,非常直觀;
適用范圍:特別適合樣本數(shù)量超過1500個以上,位點數(shù)量比較少的SNP分型。
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客戶需要提供:
1. 細胞,組織或血液等樣品材料,基因組DNA提取費用單獨收費;
2. 基因組DNA(體積≥30μl,濃度≥50 ng/μl),純度 OD260/280 為1.7~1.9之間;
3. 人類基因組需提供SNP位點的RS號。其它物種如牛、雞、魚等無rs號的,需提供SNP位點上下游各200bp的確切序列,SNP位點的突變類型,以及位點的上下游25bp內(nèi)是否存在其它連鎖位點。
最終提交結(jié)果:
1. SNPs結(jié)果(ExceL表格);
2. 完整實驗報告:擴增和反應(yīng)體系、所涉及的引物、探針序列;
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